·El síndrome de Pfeiffer se clasifica en tres subtipos clínicos según sea la gravedad :
- El tipo 1 o síndrome de Pfeiffer "clásico", incluye a los individuos con manifestaciones leves como braquicefalia, hipoplasia de la porción media de la cara y anomalías de los dedos de los pies y de las manos. Se asocia con una inteligencia normal y con un pronóstico general bueno.- El tipo 2 incluye cráneo en hoja de trébol, proptosis muy severa, anomalías de los dedos de los pies y de las manos, anquilosis o sinostosis de los codos, retraso del desarrollo psicomotor y complicaciones neurológicas.
- El tipo 3 es similar al tipo 2 pero no presenta cráneo en forma de hoja de trébol.
Puede presentarse también un solapamiento de signos clínicos de los tres tipos desíndrome.